2008年3月28日下午，学校召开关于深化校院两级管理制度改革工作安排会议。常务副书记王万忠、副校长赵忠、侯曦、王跃进、张雅林、吴普特出席会议，领导小组成员单位党委校长办公室、科研处、教务处、人事处、研究生院、计划财务处、实验室管理处、国有资产管理处、后勤处、政策研究室负责人以及相关人员参加了会议。会议由王万忠常务副书记主持。
王万忠常务副书记根据学校的总体改革目标对校院两级管理制度改革工作做了说明，提出会议的两项主要议程：一是再次讨论明确学校校院两级管理改革的整体思路；二是明确今年的改革目标和具体做法。并就《深化校院两级管理制度改革工作方案》的主要内容，从学院绩效评估、财务预算办法、人事管理权限下放程度、院系教授委员会制度要点、学院与学校发展的关系、资产配置与有偿使用制度、大型仪器设备共享、水电暖收费制度改革、基层学术机构建设等九个方面做了明确指示。
副校长赵忠、侯曦、王跃进、张雅林、吴普特以及各个成员单位负责人就各部门所承担的改革任务的核心问题、设计思路、协调推进等具体内容进行了深入细致的分析和研究。
王万忠常务副书记在总结讲话中要求各部门各单位要抓紧时间拿出每项工作的具体方案，争取上半年开好头，在学校财力有限的情况下，先下放两个学院进行试点工作，为下一步全面深入推进校院两级管理积累经验。